Au cours du VIIème siècle av. J.-C. Ephèse, comme les autres cités ioniennes, dut subir les invasions cimmériennes. La question de savoir Si la ville d'Ephèse a été effectivement prise par les Cimmériens n'a pas été élucidée. Les découvertes provenant des fouilles montrent que le temple d'Artémis a été détruit par un incendie. Si rares soient-elles, les Cimmériens ont tout de même laissé à Ephése des oeuvres d'art spécifiques comme, par exemple, la figure de bélier en ivoire qui est exposée dans la salle de l'Artémision au Musée d'Ephèse. Après l'ouragan cimmérien qui ne dura guère, Ephèse se ressaisit et commença à se développer rapidement.

    Le VIème siècle av. 1.-C. est l'une des périodes les plus brillantes de l'histoire d'Ephèse: c'est l'époque où vivent les poètes Kallinos et Hipponax et surtout le fameux philosophe Héraclite qui apporta une grande renommée à l'Ecole Ionienne. Il soutenait que le feu était l'élément fondamental et que toute chose en tirait son essence. On sait qu'il dédia au temple d'Artémis son oeuvre "De la Nature" dont une partie nous est parvenue.

    A cause de cela, la renommée d'Ephèse s'étendit à tout le monde antique et c'est ainsi que le roi de Lydie, Crésus, la choisit comme premier but de ses conquêtes (560 av. 1.-C.).

    Durant l'attaque, les Ephésiens se retirèrent derrière une corde tendue entre le temple d'Artémis et la ville car ils croyaient que la Déesse allait les protéger. Mais, contrairement à leurs espoirs, l'armée lydienne pénétra dans la ville. Contrairement à ce qu'attendaient les Ephésiens, Crésus se comporta amicalement. Mais en dépit de cela, les habitants furent obligés de quitter la ville établie sur le Mont Coressos pour aller vivre dans une seconde ville créée dans les environs du temple d'Artémis. Ayant été recouverte par les alluvions du Caystre (appelé aujourd'hui küçük Menderes), cette zone d'habitation se trouve maintenant à 10 mètres en-dessous de la surface du sol moderne et il est peu probable qu'en dehors de la zone du temple d'Artémis, on procède à des fouilles archéologiques.

    A l'époque où les Lydiens prirent la ville, l'Artémision archaïque (564-546 av. J.-C.) n'était pas encore achevé. Pour gagner les faveurs de la Déesse et des Ephésiens, Crésus fit don au temple de statues de génisse en or et de chapiteaux sculptés sur l'un desquels il fit graver son nom (Ces chapiteaux et de nombreux objets trouvés dans le temple au cours des fouilles commencées en 1869, furent emmenés au British Museum.). A la même époque, la ville fut entourée par une muraille qui partait du port et enserrait la zone d'habitation établie par l'Artémision.
 

 
Le temple d'Artémis après les pluies